国医大师任应秋先生在他的《伤寒证治类诠》中说：“《伤寒论》是仲景总论，主要内容是对一切疾病辨证施治的大原则。《金匮要略》是仲景书的分论，主要内容谈的是对各个独立疾病的治疗方法。”
任应秋先生“《伤寒论》就是疾病总论”的观点，可溯源至300年前清朝著名医学家徐灵胎的“医者之学问，全在明伤寒之理，则万病皆通”，甚至在700年前的金元四大家之一朱丹溪也有类似观点:“仲景诸方，实万世医门之规矩准绳也，后之欲方圆平直者，必于是而取则焉。”由此可见张仲景《伤寒论》在中医学中的崇高地位和对后世中医的指导作用。
现在中医界比较公认的《伤寒论》版本，多据明朝赵开美复刻的宋本《伤寒论》。宋本《伤寒论》的文章结构，是以条文形式组成的，共计有398 条，其中的第1条至11条，均有论而无方。有学者认为这11条是《伤寒论》的纲领，是太阳病篇乃至《伤寒论》全书的总论，剩下的条文是分论。所谓总论，就是全面而概括的论述，对全书有提纲挈领的作用。简单以《伤寒论》的前11条作为全书的总论，似乎说服力不够，不够严谨。笔者认为，能起到提纲挈领，提出重要论断，对后世有高度指导意义的条文，可能有如下几条：
7条：病有发热恶寒者，发于阳也。无热恶寒者，发于阴也。发于阳，七日愈。发于阴，六日愈。以阳数七阴数六故也。
本条指出如何辨别阴证、阳证，可以认为是阴阳的辨证纲要。《素问·阴阳应象大论》说：“夫善诊者，察色按脉，先别阴阳。”辨别阴阳，是中医辨证施治的核心要义，因此可以说，第7条是全书最重要的纲领性条文。但此处的“阴阳”二字，不同的注家有不同的解释，可谓横岭侧峰，见仁见智。
1. 阳经阴经说：持本观点者认为，疾病表现为发热恶寒的“发于阳”，是指病发于三阳经脉；而无热恶寒的“发于阴”，是指病发于三阴经脉。如清朝名家钱天来称：“发于阳者，病入阳经而发也；发于阴者，邪入阴经而发也。”另一清朝名家尤在泾也持此说：“此条特举阳经阴经受邪之异”，“发于阳者，病在阳之经也”；“发于阴者，病在阴之经也。”
2. 营阴卫阳说：清初名医喻嘉言认为：“风为阳，卫亦阳，故病起于阳；寒为阴，营亦阴，故病起于阴。无热恶寒，指寒邪初受未郁为热而言也，少顷郁勃于营间，则仍发热矣。”吴谦的《医宗金鉴》亦持此说：“病谓中风伤寒也。有初病即发热而恶寒者，是谓之病发于卫阳者也；有初病不发热而恶寒者，是谓伤寒之病，发于营阴者也。”
3.太阳少阴说：持本观点者认为，发热恶寒多见于太阳，无热恶寒多见于少阴，认为“发于阳”为病发于太阳，“发于阴”为病发于少阴。如清朝名家张志聪认为：“此言太阳少阴之标阳标阴为病也。以寒邪而病太阳之标阳，故发热恶寒而发于太阳也；以寒邪而病少阴之标阴，故无热恶寒而发于少阴也。”
4.不必凿分说：清朝名医柯韵伯认为“无热指初得病时，不是到底无热。发于阴指阳证之阴，非指直中于阴。阴阳指寒热，勿凿分营卫经络。”仅以发热与恶寒两个症状辨别阴证阳证，确难符合实际。以邪气的阴阳、病性的阴阳、病证的阴阳等来综合判断病变机理，此说较为中肯。
11条：病人身大热，反欲得衣者，热在皮肤，寒在骨髓也；身大寒，反欲不近衣者，寒在皮肤，热在骨髓也。
本条指出如何辨别真假寒热，可以认为是寒热的辨证纲要。在临床上，表里均寒与表里俱热都好辨别，但真寒假热，或真热假寒，有时就难于辨别了。病人身体自觉很热，反而想多穿衣服的，肌肤的热是假热，体内的寒才是真寒；病人身体自觉很冷，反而不想穿衣服的，肌肤怕冷是假寒，体内的热才是真热。临床上是可以见到类似情况的，如少阴阳气虚衰，阴寒内盛，虚阳浮越，即真寒假热的格阳证，可用通脉四逆汤。白虎汤证也有手足厥冷，反不欲近衣的情况出现，“厥深热亦深”，属热郁于内，阳气不能外达，出现的真热假寒（内热表寒）证。
16条：太阳病三日，已发汗，若吐、若下、若温针，仍不解者，此为坏病，桂枝不中与之也。观其脉证，知犯何逆，随证治之。桂枝本为解肌，若其人脉浮紧，发热汗不出者，不可与之也。常须识此，勿令误也。
本条体现了中医学最重要的特征之一辨证论治的精神。16条最重要的字眼是“观其脉证，知犯何逆，随证治之”，此处12个字被后世认为是中医辨证论治的最早表述，可见其意义何等重要。太阳病，无论是太阳表实证，还是太阳表虚证，均应用汗法，但表实证应用麻黄汤发汗解表，表虚证应用桂枝汤调和营卫，并啜粥温覆助汗，胃气旺而正汗出，邪去而正不伤。但如果太阳病汗不得法，病必不除。医者见汗法不行，又改用吐法、下法、温针等，仍不能缓解的，已属坏病，不再是太阳中风证了，不能再用桂枝汤，此时应该辨证审因，随证施治。
58条：凡病，若发汗，若吐，若下，若亡血、亡津液，阴阳自和者，必自愈。
本条体现了中医学的治疗机理。58条其中最重要的字眼是“阴阳自和者，必自愈”，讲的是疾病自愈的机理，即阴阳平衡者，疾病有机会自愈。句首讲“凡病”，包括任何疾病。病后不管你用什么治疗方法，包括发汗、吐法、下法；也不管你的治疗方法对患者造成了什么样的损害，包括亡血（耗损血液）、亡津液（耗损津液），甚至亡阳（耗损阳气），只要患者的阴阳能恢复平衡，病是有机会自愈的。临床上我们可以见到，有些病是自限性疾病，如病毒性感冒，洗个热水澡，出一身大汗，病就可能好了。由此可知，治疗过程中要仔细观察患者的阴阳变化，如果患者的阴阳有自和的趋向，可以不必做过多的治疗，让患者适当休息，规律生活，使其自愈。类似的条文还有，如398条：“病人脉已解，而日暮微烦，以病新差，人强与谷，脾胃气尚弱，不能消谷，故令微烦。损谷则愈。”“损谷则愈”，是因为胃气尚弱，消化力差，控制饮食，稍加时日，病慢慢就好了，也是体现“阴阳自和”。
148条：伤寒五六日，头汗出，微恶寒，手足冷，心下满，口不欲食，大便硬，脉细者，此为阳微结，必有表，复有里也。脉沉，亦在里也。汗出，为阳微。假令纯阴结，不得复有外证，悉入在里，此为半在里半在外也。脉虽沉紧，不得为少阴病。所以然者，阴不得有汗，今头汗出，故知非少阴也。可与小柴胡汤。设不了了者，得屎而解。
本条首次提出中医学的病位包括表、里、半表半里。148条最重要的字眼是“半在里半在外”，金·成无忌在《注解伤寒论》中将其表述为“半表半里”。张仲景在表里之外，首次提出“半表半里”的概念，可以说是创举。在哲学意义上，表里为二分法，表里加上半表半里，就是三分法了。由此将二分法的阴阳学说，扩展为一分为三的辨证方法，如在病位辨证中，有表证、里证和半表半里证；在寒热辨证中，有寒证、热证和寒热错杂证；在虚实辨证中，有虚证、实证和虚实错杂证。世界是纷繁复杂的，并非非黑即白，也有灰色地带，疾病也是如此。病位中的半表半里，可理解为既不在表也不在里，或既在表又在里，或既不在表又不在里，临床辨证中引入半表半里的概念，会有宽广的思辨空间。
以上所言可能有失偏颇，仅作引玉之论。