肾藏先后天之精，肾精化为肾气。其中，对机体有温煦、激发、兴奋、蒸化、封藏和制约阴寒等作用者，称为肾阳，亦称为元阳、真阳、真火；对机体有滋润、宁静、成形和抑制过度阳热等作用者，称为肾阴，亦称为元阴、真阴、真水。
肾阳能促进人体的新陈代谢（即气化过程），促进精血津液的化生并使之转化为能量，使人体各种生理活动的进程加快，产热增加，精神振奋；肾阴则抑制或减缓人体过度的新陈代谢过程，使精血津液转化的能量减少，人体各种生理活动的进程减慢，产热相对减少，并使气聚成形而为精血津液，精神也趋于宁静内守。二者相反相成，共同调节、控制人体的脏腑功能活动和精血津液的代谢过程。
(1) 腰痛
腰痛多见于肾虚诸证，故以补肾温肾为主，沈老亦长于治疗肾虚诸证。温和疏化法补肾益血，祛风寒湿痹，用于腰背酸痛、上连颈项等症；聚宝丹用于气血凝滞之腰痛，又治闪挫或跌仆损伤之腰痛；青娥丸性非大补而系燥热，故肾阳虚弱或受寒湿以致腰痛者，均可用之；鹿茸丸治肾阳衰弱之腰痛。
① 温和疏化法（张简斋方）
【组成】橘核 7.5g，桑寄生 20g，秦艽 10g，秦当归 10g，桂枝 5.6g，白芍 10g，杜仲 10g，炒怀牛膝 7.5g，云苓 15g，甘草 2.4g，干姜 2.4g，炒防风 7.5g，地黄 20g，北细辛 1.2g，川芎 5g。
【按】本方用四物汤合秦艽养血祛风，桂枝温经散寒，防风、细辛散风胜湿，干姜、茯苓温脾除湿，杜仲补腰膝，牛膝、桑寄生强筋骨，橘核主腰肾冷痛。综合诸药性效，全方补肾益血，祛风寒湿痹，用于腰背酸痛、上连颈项等症。本方除治腰背痛外，慢性风湿性关节炎亦可酌用。
② 聚宝丹（《顾氏医镜》）
【组成】木香 15g，沉香 15g，砂仁 15g，麝香 2.4g，延胡索 15g，乳香 15g，没药 15g，真血竭 6.5g。
【煎服法】为细末，糯米粉糊丸，如弹子大，朱砂为衣。或酒，或随证用汤化服。
【按】顾靖远云：“此方气血兼理，治诸痛颇效者，以凡痛必因气滞血凝故也。” 本方用沉香、木香、砂仁调气，麝香辛香止痛，乳香、没药、延胡活血，血竭散瘀。本草记载没药主金创杖伤，血竭主金创折跌，故本方除用于气血凝滞之腰痛外，又治闪挫或跌仆损伤之腰痛。
③ 青娥丸（《太平惠民和剂局方》）
【组成】胡桃 20 个，补骨脂 300g，蒜 120g（熬膏），杜仲 800g。
【煎服法】共为末，丸如桐子大，温酒下，妇人淡醋汤下 30 丸。
【按】杜仲补肝肾、强筋骨，胡桃、补骨脂温补命门，以上 3 味均主腰脚痛。大蒜辛温，祛寒湿。综合各药性效，可知本方性非大补而系燥热，故肾阳虚弱或受寒湿以致腰痛者，均可用之。
(2) 遗精
遗精多为梦中泄精，偶尔遗精为正常现象，但多梦遗为病。沈老从不同角度治疗遗精，如宁心益肾固精法固精并清心火，交心肾；益胃固精法以补肾水、敛元精、安心神、清相火为主，可为遗精治法的一般准绳；填精潜阳固涩法以补精潜阳为主，养阴固精为辅，用于肾精素亏、相火易动之证；大补阴丸滋肾阴、泻相火，用于火动精遗之证；桂枝加龙骨牡蛎汤固涩止遗、调和营卫，用于虚劳遗精、小腹弦急、目眩及心悸、失眠、遗尿等症。
① 宁心益肾固精法（《评琴书屋医略》）
【组成】桑螵蛸 15g，云茯神 15g，大麦冬 10g，建莲子（连心）25g，熟枣仁 7.5g，制远志 1.5g，龟甲 25g，龙骨 15g（先煎）。
【加减法】或加莒蒲、云黄连各 0.9～1.2g 为佐。
【按】本方为治梦中泄精之常法。桑螵蛸、龟甲补肾，龙骨、莲肉固精，茯苓、枣仁宁心，麦冬清心火，远志交心肾。本方用药不多，对遗精的病因治疗已面面顾到，古人立方精义，于此可见一斑。
② 益肾固精法（丁甘仁方）
【组成】生地 15g，山萸肉 15g，煅龙骨 15g，煅牡蛎 15g，怀山药 15g，泽泻 15g，金樱子 15g，茯神 15g，天冬 15g，北芡实 15g，川黄柏 7.5g，远志 7.5g，白蒺藜 15g，女贞子 15g，莲蕊须 10g。
【按】侯敬舆按：“此治遗精之要法也。以生地、怀药、萸肉、泽泻，取六味地黄丸之四以补肾，黄柏、芡实益肾，天冬补肺，蒺藜（宜用沙苑蒺藜）聚精，茯神、远志养心，龙骨、牡蛎、金樱、莲须涩精。于是心肾相交，精关固闭，而遗精可愈也。”
顾靖远云：“梦遗者，因梦交而精始出，精滑者，不因梦而精自泄。症状不同，有小便后出多不禁者，有不小便而自出者，或茎中痒痛，常欲如小便者，由肾水虚衰，相火妄动所致。” 又引沈氏云：“遗病多端，治法大要，总不越乎补肾水，敛元精，安心神，清相火为主。” 二氏之说简明扼要，可作为遗精治法的一般准绳。
③ 填精潜阳固涩法（林珮琴方）
【组成】熟地（用砂仁 15g 拌）150g，鱼鳔胶 50g，龟甲 100g，煅牡蛎 100g，山药 100g，莲肉（去心）100g，菟丝子 100g，茯苓 100g。
【煎服法】共研细末，以猪脊髓和，炼蜜为丸，每服 15g，日服 2 次。
【按】本方用熟地、鱼鳔、猪脊髓厚味填精，龟甲、牡蛎介类潜阳，山药、莲子、菟丝养阴固精，茯苓宁心泻火。综合各药性效，以补精潜阳为主，养阴固涩为辅，用于肾精素亏，相火易动之证。
(3) 阳痿
阳痿一病，多为心病，中药调理亦可。沈老在治疗阳痿方面也有一定的成就。临床上沈老使用葆真丸以温补少阴为主，兼顾厥阴、太阴二经，功能补元阳、涩精气、缩小便、暖腰膝、祛寒湿；用河车大造丸阴阳兼顾，不寒不燥，不仅生精养血、补肾种子，而且有须发、固齿牙、润肌肤、壮筋骨之功；用玉霜丸温补肾阳，固涩精气；用羊肾酒补肾益精，能补腰膝、坚筋骨、祛风湿痹，治老人脚足无力。
① 葆真丸（《证治准绳》）
【组成】鹿角胶 400g，杜仲 150g，巴戟肉 50g，远志（甘草汤泡去骨）50g，怀山药 150g，益智仁 50g，五味子 50g，茯苓 150g，大熟地 150g，淡苁蓉 100g，川楝子 50g，沉香 25g，补骨脂 50g，山萸肉 150g，胡芦巴 50g。
【煎服法】以上共为细末，入沉香和匀，以苁蓉好酒煮烂如糊，同炼蜜杵匀，丸如梧子大。每服 50 丸，空心温酒下，以美食压之。
【按】熟地、萸肉、苁蓉、巴戟、鹿角温补肾经，益智仁、补骨脂、胡芦巴补命门之火，杜仲补肝健筋，五味补肾涩精，远志补精壮阳，山药、茯苓、沉香健脾调气，川楝子泻肝火。综合各药性效，本方以温补少阴为主，仍兼顾厥阴、太阴二经，功能补元阳、涩精气、缩小便、暖腰膝、祛寒湿，用于肾气虚衰、阳事痿弱、精寒无子等症。
② 河车大造丸
【组成】紫河车 1 具，嫩鹿茸 100g，虎胫骨（狗骨代）100g，大龟甲 100g，怀生地 400g，怀山药 200g，泽泻 150g，白茯苓 150g，牡丹皮 150g，山茱萸 200g，天门冬 150g，麦门冬 150g，辽五味 150g，枸杞子 200g，补骨脂 100g，当归身 200g，菟丝子 150g，怀牛膝 150g，川杜仲 150g，淡苁蓉 150g。
【煎服法】磨细末，炼蜜为丸，如梧子大。
【按】本方首用六味地黄丸协菟丝、牛膝、杜仲补肝肾，补骨脂、苁蓉补命门，鹿茸、枸杞生精助阳，龟甲、二冬滋肾润燥，河车、当归大补气血，五味敛肾涩精，虎骨健骨祛风。综合各药性效，全方阴阳兼顾，不寒不燥，不仅生精养血、补肾种子，而且有乌须发、固齿牙、润肌肤、壮筋骨之功，用于虚损阳痿。
③ 玉霜丸（《太平惠民和剂局方》）
【组成】龙骨 500g，牡蛎 150g，木贼 150g，牛膝 100g，磁石 100g，紫巴戟天 100g，泽泻 100g，石斛 100g，朱砂 100g，肉苁蓉 100g，茴香 50g，肉桂 50g，菟丝子 100g，鹿茸 100g，韭子 100g，天雄 50g。
【煎服法】上药为细末，酒炼蜜各半，和丸如桐子大。每服 30 丸，空心、晚食前温酒下。
【按】龙骨固精；牡蛎固阳；天雄、肉桂补命门，主脾虚寒泻；茴香补命门，调中开胃；鹿茸养血助阳，主腰肾虚冷；韭子补肝肾，主遗尿泄精；菟丝、巴戟强阴益精，苁蓉、牛膝益髓强筋，以上四味功专补肾；石斛强阴；泽泻泻肾；磁石补肾；丹砂镇心。综合各药性效，全方温补肾阳、固涩精气，用于肾虚滑精、脾虚久泻、阴痿失尿、腰膝冷痛等症，久服续骨连筋、秘精坚髓、安魂定魄、健身壮阳。徐灵胎云：“此药秘精纳气，肾中阳虚者最宜。” 可谓扼要之论。
(4) 小便不禁
小便不禁乃膀胱功能失衡，不能开关自如所致。沈老在治疗小便不禁方面也有几个常用方。固脖丸补肾益阴敛强，以助其封藏，固其腭气为主；桑螵蛸心肾并补，尤能制小便过多，对神经衰弱、健忘、尿频等症，功效颇著；麦味地黄汤用六味地黄合麦冬滋阴清火，五味补肾敛气，乃治肝肾阴虚，小便不禁之方。
① 固脬丸（顾靖远方）
【组成】熟地 400g，枸杞子 200g，山萸肉 200g，五味子 50g，煅龙骨 150g，煅牡蛎 150g，覆盆子 200g，续断 200g，台党参 200g，柏子仁 200g，鸡肠 1 根，猪 1 个，紫河车 1 个（焙干研）。
【煎服法】共磨为粉，糯米糊为丸，桐子大，空心白汤下。
【加减法】夹热加知母、黄柏、天冬、麦冬、白薇，夹寒加补骨脂、益智仁。
【按】顾靖远云：“此方补肾益阴敛涩，以助其封藏，固其脖气为主，当因其证之寒热而随宜加减之。”
② 固脬汤（沈芊绿方）
【组成】桑螵蛸 10g，黄芪 25g，沙苑子 15g，山茱萸 15g，当归 10g，茯苓 10g，白芍 7.5g，升麻 1.5g，羊脖 1 个（煎汤，代水煎药）。
【按】本方用黄芪补气；升麻升气；当归、白芍补血；螵蛸、萸肉、沙苑子补肾，且为小便不禁之专药；茯苓补心，止小便过多。综合各药性效，全方补气益血、补肾固脱，对老人肾气虚弱，小便频数或不禁者，用之有效。
③ 桑螵蛸散（寇宗奭方加减）
【组成】桑螵蛸 20g，党参 15g，归身 15g，龟甲 20g，茯神 20g，龙骨 15g，远志 7.5g，菟丝子 20g，覆盆子 20g。
【按】本方以党参、当归补气血，龟甲、远志、龙骨、茯神养心安神，桑螺蛸、菟丝子、覆盆子补肾而缩小便。综合各药性效，全方心肾并补，尤能制小便过多。
(5) 尿血
沈老认为尿血的病机在于肾虚；血淋的病机在于湿热蕴结下焦，迫血妄行所致。故在治疗尿血时，坚持以补肾止血为大法，而治疗血淋则以凉血止血、清热利水为其总则。
① 治尿血方（《评琴书屋医略》）
【组成】龟甲 50g，菟丝子 20g，大生地 25g，鹿角霜 15g，当归 7.5g，建莲肉 25g，乌梅炭 2 个。
【加减法】如阴虚火炎加知母、黄柏，用猪腰子汤或京柿黑豆汤、旱莲草汤代水煎药，俱佳。
【按】潘兰坪云：“尿血之源，由于肾虚，非若血淋由于湿热，其分辨处以痛不痛为断，痛属血淋，不痛属尿血。余订是方，施治颇效…… 且此方不但治尿血，方中鸟梅炭、当归、菟丝子皆倍用，生地改用熟地，其当归、莲肉二味同用黑米醋煮透，炒干，妇女崩漏久不愈，亦曾迭效。” 本方以补肾止血为主，但鹿角与龟甲并用，不仅补肾阴，亦兼补肾阳，尿血属肾虚者，自是合宜。
② 小蓟饮子
【组成】小蓟、蒲黄、藕节、滑石、木通、生地、栀子、淡竹叶、当归、甘草各等分。
【按】小蓟、藕节祛痰止血，生地、蒲黄凉血止血，栀子导下泻火，竹叶凉心清肺，木通、滑石利窍通淋，当归、甘草和血止痛。综合各药性效，全方凉血止血、清热利水，用于小便时血淋刺痛。