坚持有是证用是方的总原则
鉴于疾病侵犯机体部位的不同，也由于个体体质的差异，可能有不少患者并不表现小柴胡汤及其柴胡类方方证。这时可以据证选方。
新型冠状病毒侵犯的脏器大多是肺，患者咳嗽、胸闷、呼吸困难，严重者可以出现急性呼吸窘迫综合征等，临床可以参考止咳平喘的经方，有麻黄汤、麻杏石甘汤、射干麻黄汤、小青龙汤、泽漆汤等。一些化痰理气的经方，如半夏厚朴汤、茯苓杏仁甘草汤可以使用，后世温病家常用的三仁汤、宣痹汤等也应考虑。
部分新冠肺炎患者表现为腹泻等消化道症状的，可以考虑有止泻和中的葛根芩连汤、甘草泻心汤、黄芩汤、五苓散等。
有些患者以极度疲劳为表现的，可以考虑使用温经散寒的麻黄附子细辛汤、附子理中汤、真武汤等。
有肾损害，出现蛋白尿的，可以使用黄芩汤、黄连解毒汤、柴苓汤等。
鉴于一些轻型患者常伴有极度的恐惧、焦虑、抑郁等，可以选用温胆汤、柴胡桂枝干姜汤、柴胡加龙骨牡蛎汤、半夏厚朴汤、半夏泻心汤等予以干预。
重视方证，强调精准治疗的专方，但是并不排斥通治方，如果发病特点完全一致的疾病，也是可以用通治方的。《素问·遗篇·刺法论》:“五疫之至,皆相染易,无问大小,病状相似。” 病相同，就可以用同一首方。这也是方证相应的一种形式。
有个体性选方，也有群体性用药
“……永嘉二年（308年），大人小儿频行风痫之病，得发例不能言；或发热，半身掣缩，或五六日，或七八日死。张思惟合此散，所疗皆愈。”这里所说的那张散剂，就是经方风引汤，其中用了大量的矿物药，如石膏、寒水石、赤石脂、紫石英、滑石、龙骨、牡蛎、大黄等。根据此病发热、抽搐，而且发病率高、死亡率高的特点，推断当年流行的可能是流行性脑炎。
明嘉靖三十八年（1559年）五六七月间，江南淮北一带流行瘟热病，用人参败毒散（羌活 独活 前胡 柴胡 川芎 枳壳 桔梗 茯苓 人参 甘草 生姜 薄荷）“本方倍人参，去前胡、独活，服者尽效，全无过失”。万历十六年至十七年（1588—1589），时疫盛行，凡是服用“人参败毒散”的人，也“无不全活”。
1891年，清末广东名医梁玉瑜途经江苏清江，见船户数人同染瘟病，浑身发臭，不省人事，开口吹气，舌见黑苔。他用家传验方十全苦寒救补汤（大黄、芒硝、厚朴、枳实、黄连、黄芩、黄柏、生石膏、知母、犀角），重用石膏四倍，循环急灌一日夜连投多剂，病人陆续泻出极臭之红黑粪，次日舌黑渐退，复连服数剂三日皆痊愈。在清江十日，以一方活49人，颇得仙方之誉。
经方组合拳：清肺排毒汤
在长期的对抗瘟疫的临床实践中，中医界流传了很多治疗时令病的成方，除以上提到的方名外，还有如防风通圣散、荆防败毒散、甘露消毒丹、十神汤等不胜枚举。
国家卫健委办公厅和国家中医药管理局办公室联合推荐的“清肺排毒汤”用于新型冠状病毒感染肺炎的临床应用（详见国中医药办医政函（2020）22号）。此方由经方小柴胡汤、麻杏石甘汤、五苓散、射干麻黄汤、橘枳姜汤相合而成，这些经方都是几千年用过来的，有经典原文的支撑，有后世许多医家的经验佐证，不妨一试。因为有经方的底子，这就是有规矩，便于临床观察疗效，便于总结经验。在目前，太需要这样的配方了。我为这种推荐方叫好！当然，仅仅靠这首方是不够的，病情复杂多变，个体差异很大，到临床还需要按照有是证用是方的原则，应对各种复杂的病情。可以说，这套经方组合拳是基本的、常用的，对付新冠肺炎的炎症风暴，应该还有几套经方组合拳！